More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1730 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 916 aa  1859    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 996 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 996 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 996 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 1004 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 978 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 914 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 917 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 995 aa  242  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  27.04 
 
 		 1042 aa  240  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 971 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 972 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  27.8 
 
 		 1010 aa  228  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 1020 aa  226  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 957 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 996 aa  214  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  25.72 
 
 		 890 aa  213  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 955 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  31.76 
 
 		 685 aa  129  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  30.7 
 
 		 684 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  30.7 
 
 		 684 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  30.7 
 
 		 684 aa  125  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  30.4 
 
 		 684 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  30.4 
 
 		 684 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  30.61 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  30.61 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  30.4 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  30.4 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  30.09 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  30.4 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  30.61 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  30.61 
 
 		 684 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  30.61 
 
 		 684 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  30.3 
 
 		 684 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  30.61 
 
 		 684 aa  120  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  30.3 
 
 		 684 aa  120  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  30.94 
 
 		 685 aa  119  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  29.25 
 
 		 685 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  28.84 
 
 		 685 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  32.05 
 
 		 1016 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  29.28 
 
 		 684 aa  110  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  35.24 
 
 		 709 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  35.24 
 
 		 709 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  28.46 
 
 		 699 aa  101  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 681 aa  100  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 764 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 769 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  30.05 
 
 		 749 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.15 
 
 		 725 aa  99.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 616 aa  99  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 659 aa  99  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  40.32 
 
 		 755 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 		 743 aa  98.6  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  41.35 
 
 		 725 aa  97.8  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  28.06 
 
 		 689 aa  97.8  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  28.5 
 
 		 783 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.28 
 
 		 719 aa  97.4  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  37.59 
 
 		 768 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  31.92 
 
 		 741 aa  97.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.52 
 
 		 765 aa  96.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.17 
 
 		 689 aa  97.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 666 aa  95.9  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 715 aa  95.5  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 714 aa  95.1  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  27.33 
 
 		 689 aa  95.1  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  32.52 
 
 		 1041 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  32.39 
 
 		 728 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  31.03 
 
 		 727 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  32.39 
 
 		 728 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  39.42 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  36.05 
 
 		 787 aa  94.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.19 
 
 		 664 aa  94.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  30.19 
 
 		 664 aa  94.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  31.03 
 
 		 727 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  31.43 
 
 		 723 aa  94  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  31.43 
 
 		 723 aa  94  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  34.45 
 
 		 728 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.83 
 
 		 837 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.6 
 
 		 729 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  26.77 
 
 		 687 aa  93.2  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  31.03 
 
 		 727 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 668 aa  93.2  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  28.44 
 
 		 689 aa  93.2  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  29.61 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  34.45 
 
 		 728 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.05 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 685 aa  92.8  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 789 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  36.05 
 
 		 786 aa  92.8  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  32.86 
 
 		 724 aa  92.8  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.86 
 
 		 805 aa  92  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  30.86 
 
 		 805 aa  92.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  34.65 
 
 		 705 aa  92.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>