More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2134 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  100 
 
 		 687 aa  1424    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  46.22 
 
 		 689 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  46.66 
 
 		 699 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  46.66 
 
 		 689 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  35.86 
 
 		 685 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  36.19 
 
 		 684 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  36.19 
 
 		 684 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  36.19 
 
 		 684 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  36.22 
 
 		 684 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  35.5 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  34.12 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  35.09 
 
 		 684 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  34.9 
 
 		 684 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  34.62 
 
 		 685 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  34.19 
 
 		 684 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  34.43 
 
 		 684 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  34.24 
 
 		 684 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  34.76 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  34.38 
 
 		 684 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  34.38 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  37.63 
 
 		 1020 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  38.31 
 
 		 996 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  38.31 
 
 		 996 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  38.31 
 
 		 1004 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  39.33 
 
 		 995 aa  225  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  38 
 
 		 996 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  35.88 
 
 		 1042 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 971 aa  218  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  34 
 
 		 957 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  33.64 
 
 		 1010 aa  191  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  35.39 
 
 		 996 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  35.81 
 
 		 917 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  32.21 
 
 		 955 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  34.8 
 
 		 978 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 914 aa  161  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  34.57 
 
 		 972 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  33.23 
 
 		 890 aa  135  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  29.94 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  29.94 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  29.65 
 
 		 676 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 625 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 675 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.05 
 
 		 748 aa  117  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 676 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 674 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.98 
 
 		 706 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.75 
 
 		 669 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.78 
 
 		 671 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 807 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.63 
 
 		 682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  28.08 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  26.52 
 
 		 677 aa  111  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 659 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 714 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.28 
 
 		 677 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 731 aa  110  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 724 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.33 
 
 		 765 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  26.65 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 726 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.23 
 
 		 892 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.95 
 
 		 690 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 743 aa  108  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.06 
 
 		 688 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  25.27 
 
 		 657 aa  107  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 768 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.02 
 
 		 739 aa  107  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 735 aa  107  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.26 
 
 		 830 aa  107  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 		 685 aa  107  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.62 
 
 		 932 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.06 
 
 		 688 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.06 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  28.06 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.41 
 
 		 849 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  26.57 
 
 		 773 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.72 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.17 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.88 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.67 
 
 		 677 aa  105  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.67 
 
 		 864 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.25 
 
 		 672 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 677 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.35 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.17 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.17 
 
 		 669 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>