More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0085 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1016 aa  2033    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  32.72 
 
 		 1019 aa  561  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.52 
 
 		 730 aa  260  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.52 
 
 		 730 aa  260  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.28 
 
 		 756 aa  259  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 735 aa  258  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.9 
 
 		 729 aa  257  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  32.09 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.57 
 
 		 718 aa  253  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.9 
 
 		 711 aa  253  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 728 aa  251  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.78 
 
 		 715 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 666 aa  248  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 845 aa  248  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 736 aa  248  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.17 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 668 aa  246  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 741 aa  243  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.68 
 
 		 694 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 744 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  28.99 
 
 		 757 aa  242  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.62 
 
 		 705 aa  241  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.94 
 
 		 745 aa  240  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 737 aa  240  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.25 
 
 		 785 aa  240  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  30.22 
 
 		 779 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  31.42 
 
 		 722 aa  239  2e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 		 829 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.6 
 
 		 671 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  28.84 
 
 		 696 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 		 707 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.49 
 
 		 732 aa  238  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 		 665 aa  237  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 742 aa  237  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.69 
 
 		 858 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.93 
 
 		 772 aa  236  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 768 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 678 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.51 
 
 		 838 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.98 
 
 		 766 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.84 
 
 		 773 aa  235  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 678 aa  234  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  27.65 
 
 		 900 aa  234  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  29.16 
 
 		 681 aa  234  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  29.58 
 
 		 672 aa  234  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 847 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 807 aa  233  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  28.21 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 845 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.26 
 
 		 794 aa  232  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  29.46 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 851 aa  231  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.34 
 
 		 765 aa  231  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 760 aa  231  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.28 
 
 		 794 aa  231  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.59 
 
 		 748 aa  231  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.68 
 
 		 763 aa  230  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 751 aa  230  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.05 
 
 		 729 aa  230  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.88 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 800 aa  230  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  27.67 
 
 		 858 aa  230  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 816 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 679 aa  229  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.78 
 
 		 741 aa  229  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.14 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 724 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.09 
 
 		 892 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 817 aa  228  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.09 
 
 		 672 aa  228  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.4 
 
 		 795 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 759 aa  228  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 833 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.43 
 
 		 731 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 742 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.68 
 
 		 674 aa  228  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 671 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 671 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.96 
 
 		 689 aa  227  8e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 746 aa  227  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.73 
 
 		 673 aa  227  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 744 aa  227  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29 
 
 		 751 aa  227  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  30.78 
 
 		 659 aa  226  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  29.53 
 
 		 678 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.02 
 
 		 672 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 831 aa  227  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.44 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.91 
 
 		 765 aa  226  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 826 aa  226  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 787 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.87 
 
 		 753 aa  226  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4021  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 848 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.34 
 
 		 816 aa  226  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  27.37 
 
 		 813 aa  225  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  29.83 
 
 		 671 aa  225  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  30.01 
 
 		 677 aa  225  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>