More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1822 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 978 aa  2003    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  70.75 
 
 		 972 aa  1369    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  35.24 
 
 		 996 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  34.93 
 
 		 996 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 996 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  34.44 
 
 		 995 aa  482  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 971 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 		 1004 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  34.64 
 
 		 1042 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  34.03 
 
 		 1010 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  32.62 
 
 		 996 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 		 955 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 1020 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  32.68 
 
 		 957 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  36.67 
 
 		 917 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  35.41 
 
 		 914 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  29.52 
 
 		 890 aa  272  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  29.87 
 
 		 916 aa  262  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  40.73 
 
 		 685 aa  221  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  38.41 
 
 		 684 aa  208  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  39.17 
 
 		 684 aa  207  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  39.17 
 
 		 684 aa  207  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  39.17 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  39.17 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  39.17 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  39.17 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  37.67 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  37.75 
 
 		 685 aa  206  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  38.85 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  37.67 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  39.05 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  37.67 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  38.31 
 
 		 684 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  38.14 
 
 		 684 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  34.71 
 
 		 685 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  38.14 
 
 		 684 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  38.14 
 
 		 684 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  38.14 
 
 		 684 aa  201  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  37.82 
 
 		 684 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  39.25 
 
 		 699 aa  195  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  36.21 
 
 		 685 aa  194  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  38.7 
 
 		 689 aa  190  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  37.89 
 
 		 689 aa  189  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  35.77 
 
 		 684 aa  187  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  36.05 
 
 		 687 aa  171  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  34.84 
 
 		 725 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.86 
 
 		 726 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  27.37 
 
 		 1066 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.81 
 
 		 819 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  29.48 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  34.18 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  32.52 
 
 		 743 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  32.76 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  32.76 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  34.9 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.78 
 
 		 825 aa  75.5  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  38.69 
 
 		 1143 aa  75.5  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  41.94 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.65 
 
 		 725 aa  74.7  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.12 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  36.36 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.11 
 
 		 830 aa  74.7  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.94 
 
 		 781 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.24 
 
 		 731 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.94 
 
 		 781 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 743 aa  73.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.09 
 
 		 783 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  30.95 
 
 		 773 aa  73.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.55 
 
 		 781 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.19 
 
 		 932 aa  73.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.34 
 
 		 1023 aa  72.8  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.73 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.17 
 
 		 786 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.57 
 
 		 735 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.82 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  31.54 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  24.43 
 
 		 749 aa  72  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 723 aa  72  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  27.57 
 
 		 787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  34.16 
 
 		 739 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  28.04 
 
 		 726 aa  72  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.61 
 
 		 713 aa  72  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 723 aa  72  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  32.87 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  31.29 
 
 		 730 aa  72  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  33.56 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  30.72 
 
 		 746 aa  71.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>