More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2292 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 996 aa  2083    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 995 aa  502  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 		 996 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  37.2 
 
 		 996 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  35.88 
 
 		 996 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  36.58 
 
 		 1004 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  34.67 
 
 		 971 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  35.36 
 
 		 1042 aa  482  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  34.78 
 
 		 1010 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 955 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 978 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  31.92 
 
 		 972 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 		 957 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  32.63 
 
 		 1020 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 914 aa  328  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  31.54 
 
 		 917 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  28.37 
 
 		 890 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  36.92 
 
 		 685 aa  220  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 916 aa  214  7.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  40 
 
 		 684 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  39.79 
 
 		 685 aa  209  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  39.45 
 
 		 685 aa  207  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  35.64 
 
 		 684 aa  207  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  35.64 
 
 		 684 aa  207  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  39.33 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  35.64 
 
 		 684 aa  207  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  39 
 
 		 684 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  39 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  39 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  39 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  39 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  39 
 
 		 684 aa  205  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  39 
 
 		 684 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  38.67 
 
 		 684 aa  204  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  38.62 
 
 		 685 aa  202  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  41.3 
 
 		 699 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  38.78 
 
 		 684 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  38.78 
 
 		 684 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  38.78 
 
 		 684 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  38.44 
 
 		 684 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  38.44 
 
 		 684 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  39.66 
 
 		 689 aa  194  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  38.31 
 
 		 689 aa  189  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  38.33 
 
 		 684 aa  184  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  35.39 
 
 		 687 aa  180  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.64 
 
 		 768 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  36.9 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 837 aa  85.5  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  34.08 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.82 
 
 		 932 aa  83.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.94 
 
 		 830 aa  82  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.03 
 
 		 706 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 678 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  28.37 
 
 		 671 aa  80.9  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.27 
 
 		 734 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  30.3 
 
 		 743 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 744 aa  80.1  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.64 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.42 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.75 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.75 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.21 
 
 		 660 aa  79.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.16 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  27.24 
 
 		 1050 aa  79  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.27 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.42 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.02 
 
 		 858 aa  79  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 762 aa  79  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.42 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.37 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  27.4 
 
 		 671 aa  78.2  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.17 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  33.13 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.21 
 
 		 762 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  30.41 
 
 		 666 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 673 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 462 aa  77.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 673 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3150  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 834 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  30.49 
 
 		 630 aa  77.4  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 673 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 743 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  30.41 
 
 		 737 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  34 
 
 		 678 aa  77  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 742 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2565  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.39 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.29 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>