More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1759 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  70.91 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  81.29 
 
 		 684 aa  1168    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  81.14 
 
 		 684 aa  1167    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  73.98 
 
 		 685 aa  1067    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 685 aa  1020    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  70.91 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  100 
 
 		 684 aa  1397    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  69.44 
 
 		 684 aa  982    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  71.2 
 
 		 685 aa  1017    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  73.83 
 
 		 685 aa  1057    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  69.59 
 
 		 684 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  81.29 
 
 		 684 aa  1168    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  70.76 
 
 		 684 aa  1024    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  68.71 
 
 		 684 aa  964    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  70.76 
 
 		 684 aa  1022    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 684 aa  1022    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  69.59 
 
 		 684 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  69.44 
 
 		 684 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  70.76 
 
 		 684 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  69.59 
 
 		 684 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  37.93 
 
 		 699 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  36.22 
 
 		 687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  35.51 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  35.23 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  43.08 
 
 		 995 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  41.69 
 
 		 1042 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  40.06 
 
 		 1020 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  39.74 
 
 		 971 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  40.62 
 
 		 996 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  41.36 
 
 		 996 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 1004 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  40.76 
 
 		 996 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  36.13 
 
 		 957 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 996 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  37.81 
 
 		 1010 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  37.01 
 
 		 978 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  35.12 
 
 		 955 aa  192  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 917 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  32.05 
 
 		 890 aa  170  6e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  35.1 
 
 		 972 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  34.27 
 
 		 914 aa  168  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  25.69 
 
 		 666 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  28.61 
 
 		 749 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  30.09 
 
 		 916 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.25 
 
 		 785 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 		 743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  27.87 
 
 		 746 aa  118  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.51 
 
 		 729 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.12 
 
 		 768 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 756 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 715 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  29.62 
 
 		 630 aa  114  5e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 705 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.73 
 
 		 932 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.65 
 
 		 765 aa  114  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.46 
 
 		 741 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.28 
 
 		 726 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 735 aa  113  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 666 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  28.57 
 
 		 829 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 779 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.7 
 
 		 797 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 786 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 677 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  26.36 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 711 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.18 
 
 		 730 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.98 
 
 		 757 aa  110  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.18 
 
 		 730 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 797 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 786 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 797 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  29.62 
 
 		 723 aa  110  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  29.62 
 
 		 720 aa  110  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.24 
 
 		 639 aa  110  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.02 
 
 		 671 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 757 aa  109  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 646 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  27.43 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 669 aa  108  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  30.5 
 
 		 724 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  29.06 
 
 		 727 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.65 
 
 		 892 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 770 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 725 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  26.92 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 685 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 724 aa  107  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  27.46 
 
 		 646 aa  106  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  30.5 
 
 		 724 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>