More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1572 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  70.75 
 
 		 978 aa  1367    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 972 aa  2000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  35.64 
 
 		 996 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  35.18 
 
 		 996 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 		 1004 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  34.7 
 
 		 996 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 995 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  33.29 
 
 		 1042 aa  456  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  31.32 
 
 		 971 aa  452  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  32.16 
 
 		 996 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  33.86 
 
 		 1010 aa  432  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 955 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 957 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  33.2 
 
 		 1020 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  35.05 
 
 		 917 aa  365  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  35.43 
 
 		 914 aa  363  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  30.1 
 
 		 890 aa  272  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 916 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  38.41 
 
 		 685 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  36.21 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  36.21 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  36.21 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  35.81 
 
 		 685 aa  190  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  35.79 
 
 		 685 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  35.43 
 
 		 685 aa  186  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  37.58 
 
 		 699 aa  186  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  37.75 
 
 		 684 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  37.75 
 
 		 684 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  37.75 
 
 		 684 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  37.75 
 
 		 684 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  35.1 
 
 		 684 aa  183  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  37.74 
 
 		 689 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  181  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  34.98 
 
 		 684 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  181  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 684 aa  181  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  36.3 
 
 		 684 aa  181  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  37.42 
 
 		 684 aa  181  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  181  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  180  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  35.97 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  37.22 
 
 		 689 aa  178  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  36.3 
 
 		 684 aa  174  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  34.57 
 
 		 687 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 783 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.8 
 
 		 783 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 744 aa  82.4  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  29.03 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  34.39 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  28.7 
 
 		 735 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 746 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.48 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.81 
 
 		 1023 aa  79.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.69 
 
 		 725 aa  79.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 787 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.19 
 
 		 726 aa  79  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 840 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 		 734 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.2 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 846 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.52 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.52 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  27.8 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  34.15 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  27.35 
 
 		 787 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29 
 
 		 731 aa  77  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 625 aa  76.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.41 
 
 		 830 aa  75.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 789 aa  75.5  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 725 aa  74.7  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  34.51 
 
 		 1143 aa  74.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 743 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 1066 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  24.74 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  28.27 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  30.82 
 
 		 764 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 676 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  30 
 
 		 773 aa  73.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.81 
 
 		 749 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.48 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 805 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.28 
 
 		 794 aa  73.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>