More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2692 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  66.37 
 
 		 684 aa  958    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  66.37 
 
 		 684 aa  958    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  76.93 
 
 		 685 aa  1107    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  66.52 
 
 		 684 aa  945    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  66.81 
 
 		 684 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  66.37 
 
 		 684 aa  957    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  66.37 
 
 		 684 aa  958    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  100 
 
 		 685 aa  1403    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  65.94 
 
 		 684 aa  933    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  69.01 
 
 		 684 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  66.23 
 
 		 684 aa  957    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  69.15 
 
 		 684 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  71.82 
 
 		 685 aa  1051    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  71.09 
 
 		 685 aa  1035    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  66.37 
 
 		 684 aa  957    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  70.91 
 
 		 684 aa  1020    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  66.67 
 
 		 684 aa  948    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  66.96 
 
 		 684 aa  950    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  66.81 
 
 		 684 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  66.37 
 
 		 684 aa  958    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  69.15 
 
 		 684 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  66.23 
 
 		 684 aa  957    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  66.23 
 
 		 684 aa  959    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  35.5 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  35.69 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  34.48 
 
 		 689 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  34.91 
 
 		 689 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  41.67 
 
 		 1042 aa  259  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  40.45 
 
 		 971 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  40.25 
 
 		 995 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  37.37 
 
 		 1020 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  41.46 
 
 		 996 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  41.3 
 
 		 996 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  41.14 
 
 		 996 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  40.82 
 
 		 1004 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  37.46 
 
 		 957 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 996 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  35.61 
 
 		 1010 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  32.96 
 
 		 955 aa  198  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  37.42 
 
 		 978 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  35.81 
 
 		 972 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 917 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  33.56 
 
 		 914 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  31.21 
 
 		 890 aa  157  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  26.1 
 
 		 666 aa  144  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 916 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  31.38 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  30.23 
 
 		 829 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  29.65 
 
 		 786 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  29.36 
 
 		 786 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  30.58 
 
 		 746 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.65 
 
 		 768 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  28.73 
 
 		 675 aa  114  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.25 
 
 		 785 aa  114  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.82 
 
 		 787 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  31.18 
 
 		 783 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.18 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  31.69 
 
 		 744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.03 
 
 		 786 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.88 
 
 		 783 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  29.49 
 
 		 634 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.06 
 
 		 671 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.86 
 
 		 743 aa  111  6e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 		 676 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.18 
 
 		 731 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.36 
 
 		 741 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  29.71 
 
 		 724 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  30.29 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.07 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.13 
 
 		 711 aa  108  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  29.71 
 
 		 724 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.43 
 
 		 825 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.73 
 
 		 932 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 1019 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  27.89 
 
 		 676 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 684 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.82 
 
 		 757 aa  107  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  29.68 
 
 		 822 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 669 aa  107  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 846 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.57 
 
 		 749 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 679 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 743 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.01 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.03 
 
 		 756 aa  106  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 790 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 786 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  26.01 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  28.23 
 
 		 734 aa  106  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>