More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1346 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  98.26 
 
 
688 aa  1399    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  95.64 
 
 
688 aa  1345    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  99.42 
 
 
688 aa  1411    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 
688 aa  1419    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  99.56 
 
 
688 aa  1414    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  99.71 
 
 
688 aa  1415    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  99.42 
 
 
688 aa  1413    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  99.42 
 
 
688 aa  1412    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  99.54 
 
 
657 aa  1349    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  98.69 
 
 
688 aa  1404    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  89.81 
 
 
684 aa  1287    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  42.99 
 
 
666 aa  535  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  35.19 
 
 
707 aa  330  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.73 
 
 
741 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.59 
 
 
759 aa  325  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  35.18 
 
 
757 aa  324  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
747 aa  324  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.42 
 
 
758 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
751 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  34.08 
 
 
753 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  34.08 
 
 
751 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
747 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
751 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
751 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 
753 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.78 
 
 
753 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 
747 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.15 
 
 
725 aa  319  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  34.71 
 
 
770 aa  317  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.74 
 
 
729 aa  312  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.28 
 
 
718 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.43 
 
 
730 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.43 
 
 
730 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  35.44 
 
 
757 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.52 
 
 
729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.59 
 
 
766 aa  308  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  33.71 
 
 
625 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.85 
 
 
748 aa  306  6e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  34.45 
 
 
678 aa  306  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.34 
 
 
785 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  34.6 
 
 
678 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 
759 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.64 
 
 
737 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 
751 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  33.9 
 
 
731 aa  303  9e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 
678 aa  303  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  33.75 
 
 
666 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  34.69 
 
 
689 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 
672 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  34.25 
 
 
678 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.44 
 
 
755 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.69 
 
 
756 aa  296  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.13 
 
 
741 aa  296  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  35.95 
 
 
749 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 
678 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 
666 aa  295  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  34.18 
 
 
696 aa  294  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  33.8 
 
 
727 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.07 
 
 
730 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 
688 aa  294  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 
768 aa  293  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 
787 aa  293  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  32.94 
 
 
779 aa  293  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.93 
 
 
757 aa  293  9e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.32 
 
 
751 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  33.43 
 
 
778 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.73 
 
 
735 aa  291  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.6 
 
 
751 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  32.98 
 
 
742 aa  291  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 
725 aa  291  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  33.7 
 
 
727 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  32.93 
 
 
665 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.86 
 
 
711 aa  287  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.78 
 
 
739 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  34.78 
 
 
722 aa  287  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  34.78 
 
 
722 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.43 
 
 
671 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  31.92 
 
 
706 aa  286  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  35.04 
 
 
722 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  33.7 
 
 
735 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  32.91 
 
 
845 aa  286  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  33.87 
 
 
728 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  34.72 
 
 
722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  33.71 
 
 
728 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  33.01 
 
 
729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  34.78 
 
 
722 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  33.92 
 
 
726 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.03 
 
 
765 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 
715 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 
744 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  32.59 
 
 
671 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  33.81 
 
 
728 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  34.88 
 
 
722 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  32.59 
 
 
671 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.43 
 
 
772 aa  283  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  34.07 
 
 
724 aa  283  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  32.02 
 
 
727 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.92 
 
 
739 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.48 
 
 
726 aa  282  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>