More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0868 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 676 aa  1372    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  63.15 
 
 		 677 aa  846    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  97.49 
 
 		 676 aa  1344    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  77.71 
 
 		 675 aa  1062    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  64.2 
 
 		 677 aa  871    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  52.82 
 
 		 692 aa  694    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  56.89 
 
 		 674 aa  758    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  55.62 
 
 		 676 aa  738    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  99.7 
 
 		 676 aa  1369    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  58.64 
 
 		 679 aa  772    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 726 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 725 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 726 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  30.78 
 
 		 731 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 745 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.3 
 
 		 743 aa  239  2e-61  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  30.96 
 
 		 754 aa  237  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 646 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 768 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 705 aa  234  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  28.77 
 
 		 720 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  29.04 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  28.77 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  29.04 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  29.04 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  28.77 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  29.04 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  28.77 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  29.04 
 
 		 720 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  28.63 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  28.63 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 681 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  28.63 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  28.9 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  28.63 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 735 aa  230  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.18 
 
 		 686 aa  229  9e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.13 
 
 		 788 aa  229  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.18 
 
 		 849 aa  227  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  31.38 
 
 		 687 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  28.49 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.46 
 
 		 689 aa  225  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.66 
 
 		 685 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 743 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.37 
 
 		 816 aa  224  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 717 aa  224  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.46 
 
 		 737 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.78 
 
 		 689 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 689 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  29.33 
 
 		 720 aa  220  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 768 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  27.87 
 
 		 680 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  29.59 
 
 		 720 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 646 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.86 
 
 		 756 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 625 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  29.15 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 		 724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 687 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  29.56 
 
 		 720 aa  217  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  29.87 
 
 		 720 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.87 
 
 		 766 aa  216  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  29.22 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.36 
 
 		 731 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 687 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 848 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.59 
 
 		 707 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.77 
 
 		 757 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  27.41 
 
 		 702 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 726 aa  214  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  28.28 
 
 		 728 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  29.05 
 
 		 779 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  29.87 
 
 		 746 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  27.9 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.96 
 
 		 686 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 688 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  28.02 
 
 		 726 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 682 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  28.55 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 648 aa  211  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.29 
 
 		 1023 aa  211  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 648 aa  211  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  28.43 
 
 		 665 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  29.17 
 
 		 900 aa  211  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.4 
 
 		 763 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 816 aa  210  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.2 
 
 		 732 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 656 aa  210  8e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.72 
 
 		 729 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  33.71 
 
 		 666 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  29 
 
 		 671 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 669 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  27.92 
 
 		 723 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 759 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.04 
 
 		 682 aa  209  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  28.87 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.74 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>