More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1235 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 676 aa  1372    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  97.49 
 
 		 676 aa  1344    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  63.65 
 
 		 677 aa  859    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  77.5 
 
 		 675 aa  1054    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  97.19 
 
 		 676 aa  1340    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  52.44 
 
 		 692 aa  690    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  62.19 
 
 		 677 aa  835    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  54.88 
 
 		 676 aa  729    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  56.3 
 
 		 674 aa  748    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  58.94 
 
 		 679 aa  769    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  31.47 
 
 		 745 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 726 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 726 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 725 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  30.96 
 
 		 731 aa  242  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 720 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  30.4 
 
 		 786 aa  238  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 705 aa  236  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.54 
 
 		 768 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  31.38 
 
 		 681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.88 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.49 
 
 		 788 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 646 aa  233  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.8 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 754 aa  233  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 681 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 717 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 735 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  31.61 
 
 		 687 aa  225  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.9 
 
 		 685 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.67 
 
 		 737 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.5 
 
 		 818 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  30.43 
 
 		 720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  30.43 
 
 		 720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.59 
 
 		 849 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 625 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 724 aa  220  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 680 aa  220  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  29.21 
 
 		 730 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  30.2 
 
 		 720 aa  220  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 		 743 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.64 
 
 		 689 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 707 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  29.17 
 
 		 728 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.23 
 
 		 816 aa  219  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 768 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 746 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  30.16 
 
 		 720 aa  218  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 826 aa  217  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.88 
 
 		 816 aa  217  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.96 
 
 		 686 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  27.45 
 
 		 702 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  31.05 
 
 		 682 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  29.37 
 
 		 721 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  28.82 
 
 		 723 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 669 aa  214  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.45 
 
 		 766 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.99 
 
 		 765 aa  214  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.45 
 
 		 682 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 659 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 779 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.52 
 
 		 825 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  27.78 
 
 		 724 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.01 
 
 		 748 aa  213  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.86 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.86 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 665 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 848 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.49 
 
 		 758 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.27 
 
 		 729 aa  211  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.08 
 
 		 732 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  30.72 
 
 		 726 aa  210  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 648 aa  210  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 648 aa  210  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 725 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 789 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 742 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  29.45 
 
 		 728 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 737 aa  208  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  29.45 
 
 		 728 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 720 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 		 706 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.99 
 
 		 772 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>