More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0740 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  52.82 
 
 		 676 aa  694    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  53.17 
 
 		 675 aa  699    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  52.67 
 
 		 676 aa  692    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  55.49 
 
 		 677 aa  734    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  56.47 
 
 		 677 aa  762    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  51.63 
 
 		 674 aa  689    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 692 aa  1422    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  52.44 
 
 		 676 aa  690    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  58.96 
 
 		 676 aa  818    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  52.65 
 
 		 679 aa  706    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 		 745 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 714 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  30.74 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 666 aa  226  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 655 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 726 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 726 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 789 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  30.17 
 
 		 786 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.29 
 
 		 689 aa  218  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  27.25 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  28.63 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.4 
 
 		 768 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  30.54 
 
 		 726 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 		 840 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 787 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 787 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.55 
 
 		 787 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 846 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 		 787 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 779 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 783 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.63 
 
 		 709 aa  210  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 709 aa  210  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  29.23 
 
 		 721 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 724 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  29.51 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.04 
 
 		 686 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.03 
 
 		 751 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  28.98 
 
 		 900 aa  208  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.37 
 
 		 743 aa  207  4e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 751 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 682 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 763 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.52 
 
 		 756 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.22 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 680 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.69 
 
 		 689 aa  205  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 689 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  29.39 
 
 		 681 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 694 aa  205  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 669 aa  204  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.82 
 
 		 725 aa  204  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 735 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 786 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 671 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 742 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.92 
 
 		 671 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.61 
 
 		 788 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.63 
 
 		 1023 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.49 
 
 		 663 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  28.67 
 
 		 702 aa  201  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 678 aa  200  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 731 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.48 
 
 		 762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 781 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.09 
 
 		 682 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.17 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.18 
 
 		 685 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 800 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  27.72 
 
 		 657 aa  198  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 757 aa  198  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 659 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.6 
 
 		 719 aa  197  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.84 
 
 		 818 aa  197  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  27.6 
 
 		 727 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 721 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 848 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 		 689 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.32 
 
 		 741 aa  196  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  26.81 
 
 		 724 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 671 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.05 
 
 		 669 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 648 aa  195  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 648 aa  195  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  29.12 
 
 		 638 aa  194  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  27.57 
 
 		 724 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.91 
 
 		 669 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.91 
 
 		 669 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  26.74 
 
 		 724 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 678 aa  193  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.91 
 
 		 669 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.03 
 
 		 825 aa  193  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.04 
 
 		 667 aa  193  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 695 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 678 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>