More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1083 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  63 
 
 
674 aa  866    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  84.1 
 
 
677 aa  1168    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  63.15 
 
 
676 aa  846    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  61.57 
 
 
676 aa  846    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  62.19 
 
 
676 aa  835    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  63 
 
 
676 aa  843    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  65.13 
 
 
675 aa  870    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  55.49 
 
 
692 aa  734    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  100 
 
 
677 aa  1370    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  68.05 
 
 
679 aa  936    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 
745 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  29.98 
 
 
646 aa  241  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 
726 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 
725 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 
668 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 
669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 
655 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.7 
 
 
783 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 
783 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  29.78 
 
 
715 aa  227  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  29.74 
 
 
790 aa  227  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.37 
 
 
659 aa  226  9e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 
666 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.74 
 
 
787 aa  224  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 
786 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 
840 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 
846 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 
787 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  29.35 
 
 
787 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 
787 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  29.21 
 
 
787 aa  220  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  29.35 
 
 
787 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  29.35 
 
 
787 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  29.35 
 
 
787 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  29.35 
 
 
787 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 
787 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  29.21 
 
 
787 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  29.21 
 
 
787 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 
719 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 
809 aa  219  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.73 
 
 
818 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 
705 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  29.85 
 
 
789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.54 
 
 
788 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 
668 aa  213  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  30.01 
 
 
793 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30 
 
 
768 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  28.51 
 
 
773 aa  211  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  28.47 
 
 
741 aa  210  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 
814 aa  210  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 
741 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.41 
 
 
671 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  30.44 
 
 
679 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 
755 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  28.67 
 
 
723 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 
726 aa  207  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 
709 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  28.02 
 
 
709 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.26 
 
 
677 aa  206  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 
677 aa  206  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.86 
 
 
686 aa  206  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 
783 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.36 
 
 
667 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 
689 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  28.53 
 
 
723 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 
741 aa  204  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.03 
 
 
662 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.32 
 
 
849 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.91 
 
 
749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.26 
 
 
785 aa  200  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 
757 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.5 
 
 
735 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 
731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 
779 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  29.59 
 
 
687 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.1 
 
 
706 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.78 
 
 
743 aa  197  5.000000000000001e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.23 
 
 
669 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.98 
 
 
669 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.04 
 
 
669 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.04 
 
 
669 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 
663 aa  197  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.03 
 
 
825 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.84 
 
 
685 aa  196  9e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.91 
 
 
682 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 
641 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 
726 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 
688 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  28.08 
 
 
671 aa  196  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 
684 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.24 
 
 
677 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.47 
 
 
766 aa  194  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.11 
 
 
796 aa  194  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 
700 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.1 
 
 
794 aa  193  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  28.21 
 
 
669 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  27.67 
 
 
731 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
678 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 
671 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  27.39 
 
 
721 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>