More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2853 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  68.27 
 
 		 684 aa  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  68.27 
 
 		 684 aa  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  68.27 
 
 		 684 aa  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  100 
 
 		 685 aa  1409    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  67.54 
 
 		 684 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  73.83 
 
 		 684 aa  1057    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  71.09 
 
 		 685 aa  1035    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  67.69 
 
 		 684 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  73.98 
 
 		 684 aa  1068    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  73.83 
 
 		 684 aa  1067    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  67.54 
 
 		 684 aa  953    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  68.13 
 
 		 684 aa  982    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  68.13 
 
 		 684 aa  981    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  67.69 
 
 		 684 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  73.98 
 
 		 684 aa  1068    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  68.13 
 
 		 684 aa  980    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  72.51 
 
 		 685 aa  1043    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  67.54 
 
 		 684 aa  963    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  67.54 
 
 		 684 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  67.84 
 
 		 684 aa  979    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  92.55 
 
 		 685 aa  1316    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  68.27 
 
 		 684 aa  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  68.13 
 
 		 684 aa  982    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  34.12 
 
 		 687 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  34.62 
 
 		 689 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  34.83 
 
 		 699 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  33.96 
 
 		 689 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  42.53 
 
 		 1042 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  43.23 
 
 		 995 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  39.08 
 
 		 971 aa  240  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 		 1020 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  40.5 
 
 		 996 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  40.19 
 
 		 996 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  40.71 
 
 		 996 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  39.2 
 
 		 1004 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  37.11 
 
 		 957 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 996 aa  207  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  35.04 
 
 		 1010 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  32.45 
 
 		 955 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  34.88 
 
 		 978 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  34.6 
 
 		 914 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  31.7 
 
 		 917 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  35.43 
 
 		 972 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  31.61 
 
 		 890 aa  159  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  26.75 
 
 		 666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.97 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 916 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  29.83 
 
 		 705 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 677 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 785 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  30.58 
 
 		 829 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.02 
 
 		 726 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.61 
 
 		 932 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  30.39 
 
 		 746 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 735 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  29.58 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 743 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  29.48 
 
 		 786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 685 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 724 aa  111  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 768 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.28 
 
 		 671 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 625 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.66 
 
 		 722 aa  109  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.92 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  27.73 
 
 		 639 aa  108  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  27.76 
 
 		 676 aa  108  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  28.53 
 
 		 675 aa  108  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.03 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  27.76 
 
 		 676 aa  107  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  29.52 
 
 		 729 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 779 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  30.12 
 
 		 724 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.79 
 
 		 757 aa  107  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.1 
 
 		 672 aa  107  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  30.15 
 
 		 728 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  30.15 
 
 		 728 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 678 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 745 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  30.15 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 736 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 743 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 653 aa  105  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  28.65 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 744 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  26.84 
 
 		 749 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 725 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 729 aa  104  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.58 
 
 		 688 aa  104  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.81 
 
 		 678 aa  104  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  26.36 
 
 		 657 aa  104  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>