More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0776 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  49.96 
 
 		 1142 aa  1013    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  47.81 
 
 		 1141 aa  1015    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1143 aa  2287    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4135  UvrD/REP helicase  43.93 
 
 		 1143 aa  834    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0055  UvrD/REP helicase  40.95 
 
 		 1112 aa  626  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1202  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1112 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 1177 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 1180 aa  327  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4751  UvrD/REP helicase family protein  31.89 
 
 		 907 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.99 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.72 
 
 		 797 aa  258  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.96 
 
 		 715 aa  258  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  32.42 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 797 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 724 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 768 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 		 732 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.78 
 
 		 757 aa  246  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.57 
 
 		 729 aa  244  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.16 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.87 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  32.91 
 
 		 707 aa  243  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.56 
 
 		 762 aa  242  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  32.33 
 
 		 779 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.14 
 
 		 755 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  31.68 
 
 		 726 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30 
 
 		 759 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.94 
 
 		 741 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 785 aa  234  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.2 
 
 		 718 aa  233  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.28 
 
 		 781 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.54 
 
 		 725 aa  233  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 807 aa  232  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 747 aa  232  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 753 aa  232  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  29.18 
 
 		 751 aa  232  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 751 aa  232  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.4 
 
 		 742 aa  232  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 751 aa  231  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 747 aa  231  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  32.07 
 
 		 688 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.08 
 
 		 753 aa  231  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.08 
 
 		 751 aa  231  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 706 aa  231  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 		 747 aa  231  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 769 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.48 
 
 		 758 aa  230  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.92 
 
 		 763 aa  230  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 744 aa  230  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.71 
 
 		 748 aa  229  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.64 
 
 		 737 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.93 
 
 		 772 aa  228  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.41 
 
 		 838 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  29.07 
 
 		 858 aa  228  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.66 
 
 		 795 aa  228  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  31.54 
 
 		 770 aa  227  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 735 aa  226  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.33 
 
 		 786 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.88 
 
 		 745 aa  225  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 728 aa  226  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.07 
 
 		 694 aa  226  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.17 
 
 		 829 aa  225  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 731 aa  224  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  31.1 
 
 		 759 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.78 
 
 		 851 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.54 
 
 		 765 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  31.39 
 
 		 741 aa  222  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 		 783 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  31.24 
 
 		 787 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.51 
 
 		 773 aa  222  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.79 
 
 		 756 aa  221  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.83 
 
 		 858 aa  221  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 786 aa  221  7.999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 681 aa  220  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.74 
 
 		 765 aa  220  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.19 
 
 		 794 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.99 
 
 		 831 aa  219  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 625 aa  219  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 714 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 730 aa  219  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 730 aa  219  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.93 
 
 		 741 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 789 aa  219  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.19 
 
 		 858 aa  218  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 778 aa  218  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 706 aa  217  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  30.17 
 
 		 739 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 705 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.62 
 
 		 669 aa  217  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.35 
 
 		 666 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.59 
 
 		 892 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.43 
 
 		 685 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.12 
 
 		 671 aa  216  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.68 
 
 		 754 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.03 
 
 		 749 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 730 aa  216  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>