More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3935 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3935  putative helicase  100 
 
 		 649 aa  1306    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3233  UvrD/REP helicase  67.03 
 
 		 628 aa  835    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.889019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46270  putative helicase  92.47 
 
 		 530 aa  976    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200631  normal  0.0695231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6473  UvrD/REP helicase  37.39 
 
 		 872 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2672  UvrD/REP helicase  35.01 
 
 		 824 aa  193  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.221431  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3150  UvrD/REP helicase  34.74 
 
 		 834 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2783  UvrD/REP helicase family protein  34.38 
 
 		 748 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2565  UvrD/REP helicase  34.93 
 
 		 714 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2511  UvrD/REP helicase  33.07 
 
 		 797 aa  177  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3303  UvrD/REP helicase  34.11 
 
 		 814 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2969  UvrD/REP helicase  33.15 
 
 		 834 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.17586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30 
 
 		 754 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  26.16 
 
 		 685 aa  97.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  28.45 
 
 		 727 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.53 
 
 		 768 aa  94.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 742 aa  94.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  31.31 
 
 		 685 aa  94.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  23.67 
 
 		 689 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 744 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  24.72 
 
 		 741 aa  90.1  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  28.4 
 
 		 699 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  22.56 
 
 		 726 aa  89.7  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  26.28 
 
 		 684 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 727 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  23.16 
 
 		 689 aa  87.4  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  26.33 
 
 		 721 aa  87.4  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 804 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  26.28 
 
 		 684 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.45 
 
 		 781 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  26.28 
 
 		 684 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  26.53 
 
 		 684 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  28.14 
 
 		 724 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.92 
 
 		 785 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  25.42 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  25.42 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  29.74 
 
 		 684 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  30.1 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  25.43 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  29.4 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  26.61 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  26.33 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  25.14 
 
 		 722 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.58 
 
 		 762 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.61 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 760 aa  83.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  29.74 
 
 		 684 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  26.3 
 
 		 829 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 728 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  29.97 
 
 		 684 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 728 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  29.39 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  25.97 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  29.97 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  29.97 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.17 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  28.9 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  27.6 
 
 		 1010 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  25.63 
 
 		 727 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  26.18 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  24.02 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.78 
 
 		 718 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  30.94 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  30.94 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  30.94 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  30.94 
 
 		 684 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.61 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  30.94 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  23.01 
 
 		 692 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.07 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  30.94 
 
 		 684 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  22.06 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  30.57 
 
 		 684 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  27.3 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  24.86 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  30.19 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.32 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 1177 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0732  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 929 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  23.14 
 
 		 726 aa  76.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 840 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.23 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  25.57 
 
 		 890 aa  76.3  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 787 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  23.46 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 724 aa  75.5  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.9 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.53 
 
 		 786 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.19 
 
 		 715 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>