More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0497 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  998    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  53.97 
 
 		 728 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  65.7 
 
 		 720 aa  997    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  54.11 
 
 		 728 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  50.62 
 
 		 728 aa  738    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  52.94 
 
 		 726 aa  792    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  49.17 
 
 		 709 aa  685    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  49.17 
 
 		 709 aa  685    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  58.55 
 
 		 724 aa  891    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  58.15 
 
 		 722 aa  883    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  54.55 
 
 		 727 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  64.19 
 
 		 720 aa  984    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  52.05 
 
 		 723 aa  747    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  53.73 
 
 		 721 aa  773    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  53.87 
 
 		 721 aa  773    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  54.61 
 
 		 727 aa  789    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.79 
 
 		 713 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  64.88 
 
 		 720 aa  975    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  57.3 
 
 		 722 aa  876    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  57.3 
 
 		 722 aa  876    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  59.15 
 
 		 724 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  56.53 
 
 		 721 aa  828    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  53.99 
 
 		 717 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  54.81 
 
 		 727 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  56.62 
 
 		 728 aa  829    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  55.16 
 
 		 726 aa  786    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  65.56 
 
 		 720 aa  989    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  52.54 
 
 		 726 aa  794    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  55.85 
 
 		 723 aa  815    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  54.25 
 
 		 728 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  53.68 
 
 		 741 aa  803    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  51.92 
 
 		 723 aa  745    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  47.11 
 
 		 743 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  998    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  65.84 
 
 		 720 aa  998    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  52.47 
 
 		 725 aa  747    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  59.28 
 
 		 723 aa  913    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  65.84 
 
 		 720 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  57.3 
 
 		 722 aa  876    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  54.06 
 
 		 723 aa  772    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  63.77 
 
 		 720 aa  980    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  54.75 
 
 		 724 aa  802    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  47.42 
 
 		 731 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  64.33 
 
 		 720 aa  984    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  52.92 
 
 		 735 aa  765    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  58.01 
 
 		 722 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  57.16 
 
 		 723 aa  872    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  52.31 
 
 		 739 aa  760    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  53.54 
 
 		 730 aa  783    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.64 
 
 		 787 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  56.43 
 
 		 646 aa  740    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  59.21 
 
 		 734 aa  912    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  58.29 
 
 		 721 aa  875    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  59.28 
 
 		 724 aa  910    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  44.72 
 
 		 826 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  51.89 
 
 		 737 aa  768    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  57.01 
 
 		 724 aa  869    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  57.81 
 
 		 726 aa  885    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  65.43 
 
 		 723 aa  999    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  54.74 
 
 		 729 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  57.73 
 
 		 721 aa  868    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  100 
 
 		 726 aa  1502    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  58.15 
 
 		 722 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  58.73 
 
 		 722 aa  880    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  54.06 
 
 		 725 aa  782    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  58.36 
 
 		 727 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  53.92 
 
 		 720 aa  767    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  63.91 
 
 		 720 aa  977    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  56.35 
 
 		 728 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  65.7 
 
 		 720 aa  997    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  65.01 
 
 		 720 aa  976    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  65.7 
 
 		 720 aa  996    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  65.7 
 
 		 720 aa  997    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  57.3 
 
 		 722 aa  875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  54.02 
 
 		 728 aa  798    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  58.54 
 
 		 721 aa  883    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  58.87 
 
 		 722 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  65.01 
 
 		 720 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.39 
 
 		 788 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  57.44 
 
 		 722 aa  880    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  53.92 
 
 		 727 aa  770    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  58.82 
 
 		 721 aa  893    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.72 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  43.52 
 
 		 790 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  43.6 
 
 		 809 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  43.68 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.11 
 
 		 786 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>