More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2969 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2565  UvrD/REP helicase  90.2 
 
 		 714 aa  1294    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2969  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 834 aa  1704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.17586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2783  UvrD/REP helicase family protein  67.91 
 
 		 748 aa  1039    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2511  UvrD/REP helicase  67.63 
 
 		 797 aa  1093    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2672  UvrD/REP helicase  66.38 
 
 		 824 aa  1134    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.221431  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3150  UvrD/REP helicase  89.93 
 
 		 834 aa  1526    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3303  UvrD/REP helicase  87.05 
 
 		 814 aa  1457    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6473  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 872 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3935  putative helicase  34.56 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3233  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 		 628 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.889019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46270  putative helicase  33.85 
 
 		 530 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200631  normal  0.0695231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  32.56 
 
 		 724 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  32.56 
 
 		 724 aa  81.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  28.02 
 
 		 890 aa  79  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  31.18 
 
 		 723 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  32.35 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  31.76 
 
 		 723 aa  73.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  27.91 
 
 		 684 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  27.91 
 
 		 684 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  27.91 
 
 		 684 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  30.99 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  29.76 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.4 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  32 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  30.81 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  30.41 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  30.23 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  30.23 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  27.52 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  30.23 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  30.23 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  29.41 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 996 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  31.03 
 
 		 728 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  37.29 
 
 		 916 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.61 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  27.52 
 
 		 684 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  30 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.82 
 
 		 741 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  28.79 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  31.21 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  30.29 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  30 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 826 aa  68.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 1020 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  30.46 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 798 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 995 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  29.76 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  30.64 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.32 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  30.46 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  26.14 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  29.59 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  28.32 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  26.06 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.06 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  28.52 
 
 		 684 aa  67.8  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  28.68 
 
 		 685 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  31.18 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  28.49 
 
 		 724 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  28.88 
 
 		 721 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  33.9 
 
 		 630 aa  67  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  28.52 
 
 		 684 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  31.93 
 
 		 724 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 825 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  26.62 
 
 		 689 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.22 
 
 		 816 aa  67  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  28.52 
 
 		 684 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  25.76 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  27.91 
 
 		 723 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  25.76 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  25.76 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.75 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  28.65 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  25.76 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  29.65 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>