More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3792 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  91.2 
 
 		 423 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0477  RND family efflux transporter MFP subunit  97.05 
 
 		 440 aa  842    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3792  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3974  RND family efflux transporter MFP subunit  97.73 
 
 		 440 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3342  RND family efflux transporter MFP subunit  85.33 
 
 		 421 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3514  RND family efflux transporter MFP subunit  76.77 
 
 		 430 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0519  cation efflux protein, putative  78.05 
 
 		 433 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0517  RND family efflux transporter MFP subunit  78.19 
 
 		 426 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0517  RND family efflux transporter MFP subunit  76.77 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4082  RND family efflux transporter MFP subunit  72.33 
 
 		 455 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0555  RND family efflux transporter MFP subunit  65.22 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3357  RND family efflux transporter MFP subunit  67.57 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.748521  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0540  RND family efflux transporter MFP subunit  67.44 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0575  secretion protein HlyD  66.3 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3189  secretion protein HlyD  61.64 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3587  RND family efflux transporter MFP subunit  63.08 
 
 		 319 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02033  Secretion protein HlyD  35.9 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.31595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1427  secretion protein HlyD  35.61 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2868  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.8 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 537 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 546 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  27.82 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  25.72 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 683 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.89 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  25 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.73 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  26.16 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 580 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.19 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  25.79 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  24.74 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  25.87 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  23.1 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  24.2 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  24.83 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.97 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  27.72 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  25.53 
 
 		 344 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 416 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.18 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  24.92 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  24.07 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>