118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0542 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  83.69 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  50 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  49.52 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  47.44 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  37.7 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  36.79 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  39.89 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  36.27 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  36.27 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  36.57 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  39.78 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  36.96 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  38.69 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  33.66 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  46.21 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  38.42 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  33.03 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  34.6 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  33.66 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  37.04 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  35.51 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  35.05 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  33.64 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  36.26 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  36.04 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  36.42 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  37.1 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  32.8 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  36.59 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  38.22 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  36.9 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  37.85 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  37.85 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  33.88 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  34.83 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  35.35 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  38.1 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  34.11 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.48 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  30.3 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  34.81 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  33.03 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  30.05 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  29.61 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  22.86 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  25.97 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.7 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.86 
 
 		 504 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  29.66 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.86 
 
 		 504 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  26.06 
 
 		 1078 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1079 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.67 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.67 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.67 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  26.67 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  27.74 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.52 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  31.58 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  29.2 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  26.29 
 
 		 504 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  24.84 
 
 		 301 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  29.46 
 
 		 538 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  28.72 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  32.23 
 
 		 515 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  28.74 
 
 		 520 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  24.31 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  27.78 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  25.6 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  24.44 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  29.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  23.97 
 
 		 498 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  30.23 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  25.9 
 
 		 757 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27.08 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  27.27 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  24.52 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  24.55 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  33.33 
 
 		 528 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  27.54 
 
 		 522 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  26.61 
 
 		 525 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  26.61 
 
 		 525 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  25.29 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  28.04 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  27.03 
 
 		 536 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  30.3 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.14 
 
 		 503 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  24.44 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  23.9 
 
 		 521 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  24.2 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  28.1 
 
 		 519 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  25.28 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  24.59 
 
 		 527 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  28.26 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>