50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1877 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  53.16 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  44.8 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  30.94 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  30.22 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  31.36 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  33.16 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  28.14 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.32 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  31.69 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  31.12 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  30.05 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  32.61 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  29.89 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  32.46 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  29.83 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  32.4 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  30.85 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  30.7 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  23.47 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  29.67 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  29.9 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  26.79 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  28.25 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  27.98 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  30.6 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  28.42 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  25.96 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  27.83 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  28.73 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  29.34 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  27.86 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  27.83 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  27.53 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  27.81 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  26.74 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  28.64 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  26.84 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  28.22 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  27.83 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  29.93 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  26.84 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  24.39 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0540  hypothetical protein  51.02 
 
 		 98 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.599994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  22.92 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>