87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0333 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  96.53 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  88.42 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  69.49 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  50.21 
 
 		 226 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  49.36 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  50.88 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  50.88 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  48.68 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  49.34 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  48.5 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  50.44 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  48.29 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  48.29 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  49.78 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  47.39 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  48.68 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  49.34 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  47.69 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  47.16 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  40.43 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  48.92 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  51.98 
 
 		 222 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  51.28 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  52.19 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  51.98 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  46.32 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  49.56 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  46.9 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  40.09 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  43.04 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  43.48 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  43.04 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.92 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  47.12 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  41.81 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  42.8 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  36.89 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  39.21 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  34.98 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  34.98 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  35.64 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  36.41 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  39.13 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  42.08 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  29.73 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  28.64 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32.64 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  29.63 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  32.93 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  35.19 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.19 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  26.28 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.18 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  29.01 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.05 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.05 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  29.2 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  34.93 
 
 		 522 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  30.77 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  34 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  33.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  27.42 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  31.43 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  27.66 
 
 		 295 aa  45.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  25.68 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  24.82 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.37 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35 
 
 		 1079 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.17 
 
 		 1078 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.17 
 
 		 1078 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  30.23 
 
 		 523 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  26.54 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  30.22 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  24.46 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.43 
 
 		 508 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.29 
 
 		 504 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30.5 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  27.96 
 
 		 275 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  27.08 
 
 		 293 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.29 
 
 		 504 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.28 
 
 		 308 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.28 
 
 		 308 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>