75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3158 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  67.69 
 
 		 224 aa  278  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  61.78 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  59.46 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  58.93 
 
 		 226 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  53.07 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  54.19 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  54.15 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  56.52 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  57.52 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  53.78 
 
 		 223 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  53.6 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  57.52 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  56.64 
 
 		 222 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  53.39 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  52.19 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  51.35 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  51.8 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  49.55 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  50.45 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  50.45 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  50.91 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.49 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  48.65 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  46.43 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  50.89 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  46.02 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  49.56 
 
 		 258 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  49.34 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  42.67 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  40.62 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  46.46 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  38.28 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  39.44 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  36.94 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  42.18 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  36.94 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  40.95 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  40.45 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  39.44 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  36.79 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  38.32 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  40.66 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  37.32 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  31.56 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  30.85 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  28.97 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.73 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  31.43 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  30.82 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2981  spermidine synthase  31.43 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.28 
 
 		 520 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.79 
 
 		 522 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  28.91 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  28.91 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  31.55 
 
 		 538 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.02 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  36.15 
 
 		 1078 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  33.02 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  36.15 
 
 		 1078 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.01 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  31.16 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  28.24 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.07 
 
 		 312 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  26.67 
 
 		 328 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.15 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  31.78 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  29.63 
 
 		 290 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  29.25 
 
 		 303 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  27.54 
 
 		 982 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  22.46 
 
 		 310 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  25.38 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 		 1109 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  26.01 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>