86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1965 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  37.56 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  39.27 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  35.55 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  37.7 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  36.47 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  36.26 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  31.56 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  29.73 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  30.04 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  29.83 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  29.36 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  31.32 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  31.87 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  29.28 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  33.5 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  31.72 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  31.28 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  29.44 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  27.57 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.89 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  27.88 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  31.11 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  29.91 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  30.22 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  30.81 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  28.14 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  27.46 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  29.73 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  27.56 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  26.42 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  27.55 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  26.42 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  25.54 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  25.26 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  28.26 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  27.72 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  23.47 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  28.64 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  28.11 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  25.11 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  24.71 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  26 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  22.73 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  24.67 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  26.83 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  25.5 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  25.17 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  26.05 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  25.32 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  25.32 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  27.91 
 
 		 301 aa  48.5  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  25.58 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  25 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  25.58 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  26.21 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  25.42 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  28.1 
 
 		 1078 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  23.33 
 
 		 522 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.98 
 
 		 504 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.98 
 
 		 504 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  24.22 
 
 		 523 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.98 
 
 		 504 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  26.98 
 
 		 504 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.27 
 
 		 1078 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  27.91 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  25.21 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  22.58 
 
 		 538 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  22.13 
 
 		 528 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  19.87 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1079 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  29.41 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  24.58 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  24.58 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  18.49 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  29.41 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  30.68 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.68 
 
 		 1017 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  29.41 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  28.24 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>