156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0451 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 233 aa  463  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  83.69 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  52.29 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  51.89 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  49.77 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  39.27 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  39.9 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  36.71 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  36.14 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  40.66 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  36.32 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  39.58 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  38.59 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  36.93 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  38.69 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  37.84 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  34.86 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  41.24 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  46.43 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  34.4 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  38.54 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  34.48 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  33.18 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  38.42 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  38.05 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  38.69 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  32.27 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  39.26 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  43.12 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  38.01 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  35.05 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  31.53 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  38.5 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.92 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  36.92 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  30.41 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  36.41 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  36.22 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  35.23 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  30.22 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  33.51 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  33.68 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  30.11 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  36.22 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32.68 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  36.71 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  38.97 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  32.12 
 
 		 1078 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  32.12 
 
 		 1078 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1079 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.59 
 
 		 508 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  27.07 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.81 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  29.35 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  29.17 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  30.46 
 
 		 520 aa  55.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  23.43 
 
 		 514 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  34.13 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  30.95 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  28.09 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.34 
 
 		 757 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  28.95 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.14 
 
 		 522 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  30.95 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.39 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.43 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  32.59 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.75 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  32.71 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  26.19 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  30.16 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  26.09 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.85 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  30.16 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  27.21 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  28.57 
 
 		 525 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  32.31 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.12 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.01 
 
 		 504 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  28.57 
 
 		 510 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.4 
 
 		 504 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.4 
 
 		 504 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.4 
 
 		 504 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  23.91 
 
 		 521 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  26.62 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  23.91 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  26.71 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  30.34 
 
 		 528 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  25.16 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  29.78 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  33.06 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  24.2 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  29.87 
 
 		 519 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  29.06 
 
 		 1017 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  32.61 
 
 		 983 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  30.56 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  25.47 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  25.47 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>