66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0311 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  487  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  90.31 
 
 		 258 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  88.42 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  68.7 
 
 		 230 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  48.92 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  48.93 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  48.67 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  49.11 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  49.78 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  46.88 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  47.19 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  49.12 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  47.58 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  48.46 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  46.12 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  47.77 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  46.12 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  41.63 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  46.46 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  51.11 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  47.2 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  44.93 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  50.67 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  50.88 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  41.74 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  45.85 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  49.36 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  46.72 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  46.9 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.29 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  46.35 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  42.73 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  42.73 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  41.74 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  39.56 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  42.31 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  35.75 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  35.47 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  37.95 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  34.92 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  35.96 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  30.49 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  44.16 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  33.63 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  26.96 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.46 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32.76 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  33.49 
 
 		 522 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35.83 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.83 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  32.69 
 
 		 521 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.33 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  29.08 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30.43 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  33.33 
 
 		 320 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  25 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  23.12 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.4 
 
 		 508 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  26.39 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  33.86 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  28.91 
 
 		 577 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  28.91 
 
 		 577 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>