53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1091 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  58.13 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  44.98 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  35.51 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  37.77 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  31.47 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  33.66 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  33.97 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  37.3 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  30.67 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  30.99 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  33.83 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  33.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  29.7 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  30.2 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  30.73 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  29.86 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  31.49 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  32.02 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  30.69 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  25.29 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  30.41 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  30 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  32.58 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.54 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  29.95 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  32.05 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  28.16 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  32.05 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  29.49 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  29.83 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  28.65 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  30.65 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  28.88 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  30.09 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  29.95 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  26.72 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  28.87 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  28.45 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  28.77 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  28.45 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  28.5 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  27.86 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  30.47 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  28.35 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0540  hypothetical protein  54.17 
 
 		 98 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.599994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  32.61 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  34.81 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  32.91 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>