135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5385 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  63.72 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  52.29 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  50 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  49.29 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  37.56 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  43.52 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  41.03 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  39.11 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  38.32 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  33.94 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  37.44 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  39.78 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  36.63 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  38.73 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.78 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  38.05 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  40.2 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  34.42 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  33.95 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  38.28 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  39.27 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  34.42 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  36.94 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  39.27 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  35.98 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  38.99 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  32.87 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  38.95 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  37.06 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  38.38 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  37.63 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  33.76 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  38.95 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  38.3 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  36.46 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  34.11 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  33.18 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  35.75 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  32.61 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  34.11 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  31.5 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  34.65 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  28.57 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1079 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  33.01 
 
 		 1078 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.01 
 
 		 1078 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  34.59 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.58 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  31.3 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  29.46 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  32.78 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.93 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  27.54 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  27.54 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  29.03 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  29.03 
 
 		 504 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  28.14 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  28.14 
 
 		 510 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  31.33 
 
 		 520 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  31.33 
 
 		 520 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  30.72 
 
 		 523 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  28.68 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  28.39 
 
 		 504 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  28.39 
 
 		 504 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  28.39 
 
 		 504 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  29.59 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  28.39 
 
 		 504 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  36.8 
 
 		 538 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  23.46 
 
 		 498 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  27.13 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  29.06 
 
 		 519 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  32.52 
 
 		 515 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  31.14 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  28.17 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  30.1 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  29.77 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.65 
 
 		 312 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  28.92 
 
 		 503 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  26.78 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  26.59 
 
 		 817 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  32.61 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  30.19 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.07 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  29.59 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  31.58 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  27.4 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  29.82 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  29.52 
 
 		 503 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  25.65 
 
 		 757 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  27.13 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  28.03 
 
 		 521 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18761  spermidine synthase  30.23 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0918674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  26.29 
 
 		 499 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  30 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  30.18 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>