76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0322 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  96.53 
 
 
259 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  90.31 
 
 
256 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  67.61 
 
 
230 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  50.43 
 
 
226 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  50.85 
 
 
228 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  51.54 
 
 
223 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  50.22 
 
 
223 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  48.46 
 
 
261 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  48.71 
 
 
226 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  48.9 
 
 
223 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  50.44 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  47.16 
 
 
254 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  49.12 
 
 
224 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  48.46 
 
 
229 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  47.81 
 
 
224 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  47.21 
 
 
223 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  47.21 
 
 
223 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  40.6 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  46.98 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  51.77 
 
 
222 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  48.26 
 
 
226 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  47.56 
 
 
223 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  51.07 
 
 
234 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  51.77 
 
 
222 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  51.98 
 
 
222 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  49.34 
 
 
224 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  40.69 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  46.09 
 
 
241 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  42.79 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.54 
 
 
225 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  42.74 
 
 
241 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  42.79 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  43.23 
 
 
234 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  41.56 
 
 
232 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  42.13 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  38.94 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  36.04 
 
 
233 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  35.45 
 
 
230 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  34.48 
 
 
238 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  34.67 
 
 
233 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  35.37 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  42.93 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  30.81 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  32.46 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  27.75 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32.11 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.9 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  32.24 
 
 
307 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  34.26 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  25.55 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  34.26 
 
 
320 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  25.81 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  33.33 
 
 
522 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.05 
 
 
328 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  27.66 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  30.77 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35 
 
 
1079 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  29.69 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  29.2 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  33 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  27.48 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  32.56 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  30.71 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  22.22 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  26.61 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.43 
 
 
508 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.52 
 
 
504 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.52 
 
 
504 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.52 
 
 
504 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.52 
 
 
504 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.52 
 
 
504 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  30.22 
 
 
280 aa  42  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.138188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>