115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2777 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  98.65 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  88.34 
 
 		 241 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  71.3 
 
 		 261 aa  317  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  68.47 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  70.27 
 
 		 226 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  68.33 
 
 		 234 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  58.85 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  56.7 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  57.14 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  58.18 
 
 		 222 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  57.27 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  58.18 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  54.26 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  57.73 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  53.95 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  51.8 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  47.56 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  57.21 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  50.44 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  52.79 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  50.22 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  42.22 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  42.41 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  47.77 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  47.86 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  46.78 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.54 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  45.15 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  43.96 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  44.17 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  45.63 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  46.12 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  42.31 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  40.28 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  36.27 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  38.21 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  36.71 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  36.32 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  34.42 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  29.44 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  37.4 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  28.73 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  27.31 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  36.29 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  25.17 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  28.87 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  32.82 
 
 		 285 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  28.17 
 
 		 303 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  33.59 
 
 		 295 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  35.11 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  31.45 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  29.41 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  34.35 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.61 
 
 		 522 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  33.67 
 
 		 431 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.43 
 
 		 308 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.43 
 
 		 308 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  30.53 
 
 		 538 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  29.24 
 
 		 1078 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.14 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.24 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  36.63 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  36.63 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  28.99 
 
 		 519 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  36.63 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  33.59 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  35.71 
 
 		 320 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.71 
 
 		 320 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  32.82 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  30.97 
 
 		 504 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  33.09 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  30.97 
 
 		 504 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.48 
 
 		 520 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  34.03 
 
 		 296 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  31.47 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  31.51 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  30.09 
 
 		 504 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  30.09 
 
 		 504 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  30.09 
 
 		 504 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>