77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2221 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  92.79 
 
 		 222 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  69.68 
 
 		 226 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  68.33 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  66.52 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  59.91 
 
 		 223 aa  266  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  62.9 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  62.22 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  62.78 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  58.64 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  61.01 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  62.33 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  62.61 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  65.6 
 
 		 224 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  60.45 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  58.3 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  58.18 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  57.21 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  58.64 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  57.52 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  54.71 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  58.18 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  54.26 
 
 		 254 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  52.51 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  45.09 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.66 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  46.43 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  51.34 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  44.84 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  51.98 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  51.77 
 
 		 258 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  44.84 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  44.84 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  44.84 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  50.67 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  43.11 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  43.93 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  41.38 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  39.32 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  37.91 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  38.54 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  39.27 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  37.85 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  26.42 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  39.58 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  29.65 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  29.74 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  32.55 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  27.49 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.89 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  31.32 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  34.68 
 
 		 533 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.92 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  34.38 
 
 		 538 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  35.94 
 
 		 522 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  32.05 
 
 		 283 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35.54 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.54 
 
 		 1078 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  31.25 
 
 		 515 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  29.69 
 
 		 523 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  27.33 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  29.13 
 
 		 508 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  28.21 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  28.49 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.96 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.96 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  39.08 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  27.55 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  29.05 
 
 		 519 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.07 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  30.89 
 
 		 521 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  32.52 
 
 		 375 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  32.12 
 
 		 296 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  37.33 
 
 		 520 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>