102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3078 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  59.62 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  55.2 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  54.15 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  58.85 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  54.73 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  56.72 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  51.38 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  53.11 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  51.96 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  52.91 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  55.2 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  50.89 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  54.26 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  54.26 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  53.3 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  52.79 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  53.5 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  52.24 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  54.07 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  50.23 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  52.97 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  48.17 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  47.44 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  44.89 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  42.34 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  43.5 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  46.55 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.06 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  43.67 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  42.61 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  38.65 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  45.4 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  39.32 
 
 		 225 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  43.82 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  38.8 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  38.25 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  33.7 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  38.27 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  36.26 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  38.01 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  49.59 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  36.46 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  33.76 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  31.11 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  33.14 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  30.88 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.69 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  27.53 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  32.8 
 
 		 523 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.92 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  29.81 
 
 		 349 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  29.81 
 
 		 375 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  26.6 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  25.5 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  25 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  29.6 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  32.5 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  26.82 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  26.82 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1079 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  24.75 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2981  spermidine synthase  35.51 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  28.69 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  29.51 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  28.97 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  28 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  28.8 
 
 		 1078 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.87 
 
 		 520 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.21 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.87 
 
 		 520 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.53 
 
 		 1078 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  30.65 
 
 		 533 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  26.9 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  26.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  26.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  26.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  26.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  26.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  26.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  31.4 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  27.59 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  26.21 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  33.83 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  26.74 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  24.86 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  36 
 
 		 520 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  26.74 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  26.74 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  27.27 
 
 		 521 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  29.59 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  29.59 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.59 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>