80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2508 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  68.64 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  47.19 
 
 
228 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  40.09 
 
 
223 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  39.71 
 
 
261 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  43.01 
 
 
226 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  40.18 
 
 
241 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  40.28 
 
 
223 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  42.23 
 
 
223 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  37.44 
 
 
226 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  39.81 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  39.73 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  39.72 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  39.42 
 
 
223 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  40.38 
 
 
226 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  42.18 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  37.95 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  40.8 
 
 
228 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  42.22 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  39.37 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  33.8 
 
 
225 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  41.87 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  41.67 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  43 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.22 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  41.38 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  41.38 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  40.62 
 
 
259 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  45.4 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  37.38 
 
 
226 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  41.03 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  36.57 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  39.89 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  37.5 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  34.15 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  36.93 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  33.17 
 
 
234 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  35.83 
 
 
238 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  31.25 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  33.5 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  32.98 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  31.61 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  38.1 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  30.16 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  33.62 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  27.91 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  32.77 
 
 
903 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  29.5 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  26.06 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  30 
 
 
520 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  30 
 
 
520 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  30.63 
 
 
520 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  35 
 
 
522 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.89 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  29.73 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  32.58 
 
 
431 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  20.43 
 
 
308 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  23.33 
 
 
313 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  33.59 
 
 
515 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  20.43 
 
 
308 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  31.39 
 
 
1079 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  32.35 
 
 
279 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  28.23 
 
 
508 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  29.37 
 
 
842 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  28.15 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  26.74 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  26.24 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  30.66 
 
 
1078 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  27.95 
 
 
523 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  25 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  30.66 
 
 
1078 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  28.44 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  31.21 
 
 
533 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  26.62 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  28.48 
 
 
876 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  28.83 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>