63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2514 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  56.5 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  57.8 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  56.05 
 
 		 223 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  52.47 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  54.13 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  52.91 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.91 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  55.76 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  52.68 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  55.61 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  54.59 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  54.13 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  54.71 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  54.26 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  53.21 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  53.64 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  51.11 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  50.69 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  50.44 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  50.67 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  54.13 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  50.22 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  49.12 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  49.33 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  48.65 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  49.78 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  47.44 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  48.33 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  47.22 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  46.51 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  43.6 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  40.09 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  47.2 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  42.65 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  44.32 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  43.33 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  42.22 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  40.38 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  41.27 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  40.51 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  37.63 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  34.81 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  36.71 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  27.56 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  27.98 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  29.47 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  26.34 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  30.77 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  25.43 
 
 		 692 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  36.29 
 
 		 903 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  33.33 
 
 		 533 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  29.75 
 
 		 520 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  28.93 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  28.93 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  32.76 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  32.76 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  27.54 
 
 		 519 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  28.57 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  27.41 
 
 		 363 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  26.32 
 
 		 805 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>