105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0173 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  63.72 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  53.36 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  49.77 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  47.44 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  37.91 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  36.47 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  38.83 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  41.87 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  39.44 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  36.79 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.91 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  39.81 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  39.57 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  38.94 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  40.78 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  39.32 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  37.68 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  38.16 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  37.44 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  37.86 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  39.9 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  36.71 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  38.39 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  36.23 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  37.21 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  41.27 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  38.27 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  38.97 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  35.83 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  35.58 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  36.95 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  35.41 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  38.5 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  36.87 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  34.98 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  37.95 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  36.59 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  37.05 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  32.55 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  31.9 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  32.76 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  36.17 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  32.76 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  35.1 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  29.89 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  32.26 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1079 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  33.73 
 
 		 520 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  33.73 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  33.73 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  31.58 
 
 		 1078 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  31.58 
 
 		 1078 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  32.62 
 
 		 523 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  28.24 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  29.41 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  29.41 
 
 		 503 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  34.05 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  27.65 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  26.32 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  27.91 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  34.72 
 
 		 538 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  27.06 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  27.06 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  27.06 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  27.91 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  32.79 
 
 		 519 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  27.06 
 
 		 504 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  24.71 
 
 		 498 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  26.04 
 
 		 525 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  26.04 
 
 		 525 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  25.57 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  30.29 
 
 		 521 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  24.68 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.79 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  33.61 
 
 		 515 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  26.98 
 
 		 817 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  27.1 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  30.89 
 
 		 533 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  24.6 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  28.93 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.07 
 
 		 508 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  31.82 
 
 		 431 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.95 
 
 		 499 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  24.05 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  30.32 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  28.1 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  21.93 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  28.89 
 
 		 527 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  22.94 
 
 		 514 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  29.82 
 
 		 536 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  25.18 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>