80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5488 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 382 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  75.99 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  73.78 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  67.88 
 
 		 384 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  77.42 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  69.72 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  30.65 
 
 		 534 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.1 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.77 
 
 		 463 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.43 
 
 		 647 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  28.1 
 
 		 547 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.93 
 
 		 550 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  28.4 
 
 		 541 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.7 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.85 
 
 		 577 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.36 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.36 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  24.79 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.19 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  29.26 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.79 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  27.71 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  27.39 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  30.69 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.93 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.46 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  27.62 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  25.33 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  26.64 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  26.64 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  27.83 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  26.61 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  27.56 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  26.92 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  26.57 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  25.76 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  27.88 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  26.61 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  26.43 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.38 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  27.17 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  25.99 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  28.72 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  24.45 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  26.44 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  28.45 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.12 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.74 
 
 		 563 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  26.84 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.16 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  28.45 
 
 		 459 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  28.71 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  27.67 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  27.59 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  28.02 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  22.62 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.24 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.29 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  27.5 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.62 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  27.59 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  27.14 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  27.75 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  27.75 
 
 		 457 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  28.02 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  26.38 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  27.61 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  24.04 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  27.66 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  27.27 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  27.59 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  26.25 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  27.71 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  27.03 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  26.72 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  26.64 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6504  hypothetical protein  27.68 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>