36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1718 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  73.64 
 
 		 534 aa  755    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 550 aa  1086    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  58.76 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  58.76 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  58.39 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.62 
 
 		 463 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  42.23 
 
 		 540 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  46.55 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.7 
 
 		 456 aa  216  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  41.85 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.35 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  28.87 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  40.87 
 
 		 323 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  29.05 
 
 		 402 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  29.85 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  30.45 
 
 		 382 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  29.24 
 
 		 384 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.8 
 
 		 647 aa  87.8  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  30.89 
 
 		 342 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.4 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  28.25 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.57 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  22.61 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  23.51 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  26.43 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.31 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  23.67 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  24.48 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1234  putative conjugal transfer protein TrbL  54.35 
 
 		 48 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.36 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  24.31 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  20.51 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  20.94 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  20.94 
 
 		 589 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.22 
 
 		 409 aa  44.3  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  25.48 
 
 		 450 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>