38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2536 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 532 aa  1016    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  66.97 
 
 		 540 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  56.43 
 
 		 577 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  56.43 
 
 		 572 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  56.43 
 
 		 572 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  43.95 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  49.27 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  41.35 
 
 		 463 aa  250  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  44.03 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  50.16 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  37.03 
 
 		 323 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.3 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  30.46 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  27.27 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  28.91 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  25.34 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.06 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  30.45 
 
 		 368 aa  91.3  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 342 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.06 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  24.91 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  26.06 
 
 		 382 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.94 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.73 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  27.73 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.73 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1433  putative plasmid conjugal transfer protein  41.24 
 
 		 124 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  28.68 
 
 		 454 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  25.45 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  24.92 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  26.36 
 
 		 438 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  28.99 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.18 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  23.41 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  27.81 
 
 		 451 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.44 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.72 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  27.75 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>