17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0251 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 563 aa  1093    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  96.08 
 
 		 589 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  96.08 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  28.35 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.52 
 
 		 647 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.7 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.31 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  22.98 
 
 		 547 aa  67  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  23.55 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  21.62 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  24.48 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  23.45 
 
 		 368 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.92 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  22.27 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.95 
 
 		 391 aa  47.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  25.44 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  27.4 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>