75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2646 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 463 aa  904    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  41.28 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  47.42 
 
 		 577 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  47.42 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  47.42 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  43.79 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  37.47 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  40.17 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  40.29 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  43.66 
 
 		 550 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  43.07 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  32.64 
 
 		 547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.22 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  29.75 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  30.94 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  28.3 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.06 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.77 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.39 
 
 		 384 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.51 
 
 		 647 aa  87  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  28.41 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  31 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  28.08 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  26.57 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  26.94 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  27.04 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  23.67 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.16 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  22.94 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  23.97 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  23.53 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  23.97 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  25.84 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  24.45 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  23.97 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  23.26 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1234  putative conjugal transfer protein TrbL  57.78 
 
 		 48 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  24.45 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  24.44 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  22.85 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  25.09 
 
 		 387 aa  54.3  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  24.88 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  23.58 
 
 		 456 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  23.14 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  29.66 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  23.5 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.28 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.5 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  25.82 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  21.72 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  27.38 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.57 
 
 		 563 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  22.99 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  24.85 
 
 		 451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  23.83 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  24.46 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.75 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  24.42 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  25.73 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  23.14 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  21.29 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  25.35 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  23.67 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  20.88 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  22.13 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  21.29 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  24.85 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  24.85 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  23.76 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  23.39 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  23.39 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  22.27 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  20.54 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>