63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1505 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 401 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  75.5 
 
 		 390 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  60.94 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  65.2 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  69.53 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  61.56 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  63.09 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  63.45 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  61.66 
 
 		 452 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  62.67 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  61.57 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  62.39 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  80.87 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  61.43 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  80.51 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  58.77 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  80.67 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  56.9 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  72.06 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  72.62 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  68.59 
 
 		 407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  68.23 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  60.22 
 
 		 468 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  61.13 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  63.36 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  68.06 
 
 		 457 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  67.3 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  52.51 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  48.78 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  46.67 
 
 		 450 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  49.5 
 
 		 387 aa  328  9e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  48.34 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 457 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  58.74 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  57.74 
 
 		 449 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.11 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.96 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.19 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  32.21 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.88 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.48 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.16 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  58.33 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.92 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  43.96 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.29 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  38.78 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  26.07 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  47.67 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  38.95 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  38.95 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.17 
 
 		 547 aa  49.7  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  25.67 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.85 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.13 
 
 		 541 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  26.77 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>