25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1488 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  100 
 
 		 70 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  50.72 
 
 		 450 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  65.85 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  68.29 
 
 		 431 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  65 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  54.72 
 
 		 454 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  56.52 
 
 		 450 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  55.07 
 
 		 454 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  63.16 
 
 		 401 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  56.1 
 
 		 419 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  70.73 
 
 		 450 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  67.44 
 
 		 451 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  50.72 
 
 		 449 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  50 
 
 		 448 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  67.44 
 
 		 450 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  45.83 
 
 		 436 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  53.03 
 
 		 450 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  47.62 
 
 		 461 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 449 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  58.54 
 
 		 439 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  54.76 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  45.65 
 
 		 407 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  61.54 
 
 		 452 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 453 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 453 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>