72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1714 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 409 aa  796    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  50.94 
 
 		 396 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.54 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  31.85 
 
 		 454 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  34.48 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  31.5 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  31.62 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.98 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  29.77 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  30.08 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  29.93 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  31.71 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  29.43 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  29.06 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  30.18 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  29.06 
 
 		 450 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  28.95 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  28.68 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  29.43 
 
 		 460 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  28.2 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  29.06 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  28.68 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  30.37 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  28.3 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  30.74 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  26.33 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  29.56 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  29.06 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  29.06 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  28.62 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  28.73 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  28.78 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  28.2 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  27.19 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.62 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  28.3 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  29.77 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  28.04 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.26 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  27.99 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  30.57 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  29.52 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  28.57 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  26.67 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  28.04 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  26.67 
 
 		 453 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  26.67 
 
 		 453 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  27.86 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  25.75 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  26.3 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  30.8 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 450 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  27.99 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  28.38 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  28.05 
 
 		 457 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.29 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.88 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.82 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.52 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25.11 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.15 
 
 		 534 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  24.59 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  23.53 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  23.28 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  22.92 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  26.42 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  26.64 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>