73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7446 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 420 aa  802    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  70.24 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  61.67 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  59.86 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  49.16 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  54.93 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  53.57 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  55.63 
 
 		 454 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  56.67 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  58.67 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  56.12 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  57.11 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  54.69 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  53.95 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  56.55 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  53.9 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  54.87 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  52.38 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  54.91 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  54.97 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  54.97 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  67.18 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  65.34 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  64.62 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  65.06 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  45.18 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  64.98 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  49.52 
 
 		 444 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  65.34 
 
 		 407 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  46.47 
 
 		 457 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  47.56 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  50.36 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  49.17 
 
 		 450 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  60.58 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  63.08 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  46.71 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 463 aa  325  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  60.98 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  58.46 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  58.46 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  58.76 
 
 		 459 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  48.5 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  59.49 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  59.12 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  58.39 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 457 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  59.56 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  61.22 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  59.56 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  58.82 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  56.88 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  59.32 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  46.83 
 
 		 449 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.17 
 
 		 437 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.52 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.56 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.58 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.48 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  29.32 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.06 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.66 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  59.18 
 
 		 70 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  27.57 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  29.5 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.52 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  26.6 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  29.55 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  26.12 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  28.4 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.31 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.69 
 
 		 493 aa  46.6  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  27.27 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>