71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1188 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 453 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 453 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  85.43 
 
 		 451 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  81.46 
 
 		 448 aa  601  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  79.07 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  81.57 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  76.6 
 
 		 450 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  82.56 
 
 		 449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  82.3 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  81.64 
 
 		 450 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  78.76 
 
 		 449 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  75.93 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  75.17 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  75 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  75.83 
 
 		 451 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  74.12 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  64.3 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  62.97 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  64.67 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  62.58 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  80.87 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  59.33 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  57.21 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  54.14 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  53.32 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  65.82 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  55.39 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  66.31 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  66.79 
 
 		 429 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  62.29 
 
 		 418 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  66.06 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  51.98 
 
 		 450 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  61.48 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  66.54 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  66.54 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  50 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  50.66 
 
 		 450 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 457 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 450 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  59.11 
 
 		 387 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  44.23 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  45.98 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.78 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.96 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.75 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  31.23 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.85 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.52 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  60.47 
 
 		 70 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.34 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  28.16 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.93 
 
 		 647 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.45 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.41 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.51 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  29.17 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  25.82 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  26.05 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  25.76 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>