57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1840 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 387 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  61.23 
 
 		 454 aa  338  9e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  63 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  51.67 
 
 		 387 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  59.29 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 450 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 450 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  47.12 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 459 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 459 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  50.87 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 461 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  57.82 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  49.74 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 457 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 464 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  47.56 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  60.14 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  60.14 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  46.53 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  59.42 
 
 		 451 aa  302  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  44.23 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  60.3 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  52.07 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  60.14 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  59.06 
 
 		 452 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  45.03 
 
 		 448 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  60.87 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  59.85 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  47.25 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  59.78 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  55.07 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  56.82 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  53.99 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  53.99 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.7 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.82 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.5 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.23 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  28.62 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.63 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.86 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.1 
 
 		 647 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  26.07 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  24.79 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  24.89 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  26.12 
 
 		 541 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  25.75 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.94 
 
 		 547 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>