74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0312 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 436 aa  834    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  64.02 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  64.37 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  65.26 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  63.23 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  64.22 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  64.59 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  66.15 
 
 		 450 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  64.97 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  64.65 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  63.47 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  64.97 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  62.44 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  62.75 
 
 		 440 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  63.17 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  62.9 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  61.33 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  59.27 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  62.08 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  58.62 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  55.29 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  55.84 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  54.84 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  70 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  68.5 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  61.19 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  50.68 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  53.74 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  52.17 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  52.71 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  53.15 
 
 		 461 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  65.81 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  53.55 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  46.68 
 
 		 468 aa  352  8e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  65.71 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  61.9 
 
 		 418 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  63.6 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  64.98 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  65.7 
 
 		 407 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  65.02 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  60.29 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  60.66 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  60.66 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  59.93 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  60.66 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  62.13 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  61.76 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  61.76 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  51.28 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  59.93 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  62.5 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  61.76 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  57.25 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  45.93 
 
 		 449 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.15 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.34 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.26 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.79 
 
 		 396 aa  116  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  27.82 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.47 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  27.08 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.46 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.46 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  23.57 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  27.36 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.42 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.81 
 
 		 547 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  26.29 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  45.83 
 
 		 70 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  26.98 
 
 		 382 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.27 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  24.64 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  23.5 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.72 
 
 		 577 aa  43.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>