67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0432 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  90.81 
 
 		 450 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 457 aa  886    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  91.9 
 
 		 450 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  89.06 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  82.35 
 
 		 444 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  77.29 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  78.91 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  78.74 
 
 		 456 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  80.35 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  80.39 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  80.43 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  81.3 
 
 		 459 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  80.91 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  81.52 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  79.83 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  80.31 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  80.82 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  79.74 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  55.92 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  50.54 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  61.48 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  65.68 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  48.81 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  50.33 
 
 		 450 aa  349  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  52.12 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  51.49 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  63.98 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  49.67 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  61.99 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  48.99 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  48.67 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  47.73 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  48.23 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  64.04 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  61.09 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  61.07 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  56.69 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  61.09 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  60.36 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  61.94 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  60.36 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  60.36 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  60.36 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  45.86 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  47.61 
 
 		 407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  56.95 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  59.7 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  57.76 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  58.74 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  55.6 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  43.43 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  36.16 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.25 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.6 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.6 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  31.41 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.77 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.58 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.5 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  29.46 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  25.77 
 
 		 534 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.53 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  24.51 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  23.5 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25.82 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>