70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2318 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 448 aa  854    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  84.15 
 
 		 449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  80.88 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  76.05 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  81.19 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  76.92 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  78.71 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  80.93 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  81.42 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  81.42 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  78.49 
 
 		 449 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  74.61 
 
 		 450 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  72.89 
 
 		 450 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  72.48 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  74.05 
 
 		 439 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  74.06 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  60.52 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  60.76 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  67.11 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  62.78 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  61.21 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  58.39 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  52.25 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  57.55 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  52.68 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  63.27 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  66.67 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  51.04 
 
 		 461 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  61.95 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  68.06 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  64.62 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  66.92 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  59.72 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 463 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  49.18 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  58.97 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  56.78 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  57.51 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 		 460 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  56.78 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  56.41 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  51.03 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  57.51 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  56.88 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  57.51 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  57.51 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  47.1 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.48 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.96 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.62 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  29.59 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.29 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.12 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  62.79 
 
 		 70 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  25 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.71 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  24.06 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  25.95 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.74 
 
 		 394 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.08 
 
 		 647 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  21.98 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  26.98 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>