66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 457 aa  889    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  94.09 
 
 		 457 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  80.74 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  91.29 
 
 		 460 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  80.45 
 
 		 450 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  84.53 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  85.12 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  88.04 
 
 		 459 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  88.26 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  88.02 
 
 		 459 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  90.09 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  82.94 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  78.99 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  86.09 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  80.68 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  87.39 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  74.55 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  75.11 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  57.55 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  52.33 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  67.16 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  62.41 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  49.57 
 
 		 450 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  50.68 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  51.56 
 
 		 452 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  50.45 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  62.45 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  49.32 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  48.2 
 
 		 448 aa  329  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  50.46 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  60.15 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  59.78 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  50 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  61.82 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  49.45 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  50.11 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  59.64 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  61.42 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  45.64 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  46.67 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  61.07 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  61.57 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  61.43 
 
 		 407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  56.07 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  58.09 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  58.43 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  54.45 
 
 		 438 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  55.43 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  44.09 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.25 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.06 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.59 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  29.45 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.97 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.36 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.41 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.79 
 
 		 647 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  26 
 
 		 541 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.57 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.53 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  22.18 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>